Ninja Gaiden это история молодого ниндзя Рю Хаябусы, отправившегося в Америку, чтобы найти убийцу своего отца. Прибыв в Америку Рю оказывается втянутым в борьбу с злодеем Джакио, который собирается освободить древнего демона, заключённого в 2 статуэтках (света и тьмы), и, с его помощью, захватить мир.