Биоинформатика и Базы данных — лекция 2 курса «Биофизика и моделирование биомолекул»

Когда в биологии, особенно молекулярной, стало накапливаться много данных — последовательностей генов и белков, а также трехмерных структур биомолекул и их сложных комплексов, — встал вопрос, куда всё это девать, чтобы не пропало. Так в биологию пришла Big Data, а также началась эра биоинформатики. В этой лекции разбираем общие биоинформатические принципы через призму основных типов данных и баз данных, в которых они хранятся. Особенное внимание уделим генетическим данным (GenBank), белковым последовательностям (Uniprot) и структурам белков (Protein Data Bank). Также рассмотрены способы поиска в базах и сравнение последовательностей между собой путем построения парных и множественных выравниваний, а также филогенетических деревьев.