Межмикросателлитные повторы (ISSR) или микросателлитная ДНК

Межпростые повторяющиеся последовательности (ISSR) или микросателлитная ДНК — в этой лекции объясняется ISSR, тип микросателлитной ДНК в геноме человека. http://shomusbiology.weebly.com/ Загрузите учебные материалы здесь: http://shomusbiology.weebly.com/bio-materials.html Микросателлиты, также известные как простые повторяющиеся последовательности (SSR) или короткие тандемные повторы (STR), представляют собой повторяющиеся последовательности ДНК длиной от 2 до 6 пар оснований.[1] Это тип тандемных повторов с переменным числом оснований (VNTR). Микросателлиты обычно кодоминантны. Они используются в качестве молекулярных маркеров в генетике, для родства, популяционных и других исследований. Они также могут использоваться для исследований дупликации или делеции генов, маркер-опосредованной селекции и дактилоскопии. Одним из распространенных примеров микросателлита является повтор (CA)n, где n варьируется между аллелями. Эти маркеры часто демонстрируют высокий уровень меж- и внутривидового полиморфизма, особенно когда число повторений составляет 10 или более.[2] Повторяющаяся последовательность часто проста и состоит из двух, трех или четырех нуклеотидов (ди-, три- и тетрануклеотидные повторы соответственно) и может повторяться от 3 до 100 раз, при этом более длинные локусы, как правило, имеют больше аллелей из-за большего потенциала для скольжения (см. ниже).[3] Нуклеотидные повторы CA очень часто встречаются в геномах человека и других организмов и присутствуют каждые несколько тысяч пар оснований. Поскольку в микросателлитном локусе часто присутствует множество аллелей, генотипы в родословных часто являются полностью информативными, поскольку можно идентифицировать предка конкретного аллеля. Таким образом, микросателлиты идеально подходят для определения отцовства, популяционно-генетических исследований и картирования рекомбинации. Это также единственный молекулярный маркер, который дает подсказки о том, какие аллели более тесно связаны.[4] Микросателлиты также являются предикторами плотности SNP, поскольку области, состоящие из тысяч нуклеотидов и фланкирующие микросателлиты, имеют повышенную или пониженную плотность SNP в зависимости от последовательности микросателлита.[5] Изменчивость микросателлитов обусловлена более высокой частотой мутаций по сравнению с другими нейтральными областями ДНК. Эти высокие показатели мутаций чаще всего объясняются проскальзыванием нитей (скольжением) во время репликации ДНК на одной нити ДНК. Мутации также могут происходить во время рекомбинации в мейозе,[6] хотя распределение геномных микросателлитов связано с участками рекомбинации, скорее всего, как следствие участия повторяющихся последовательностей в рекомбинации, а не как ее следствие.[7] Некоторые ошибки при проскальзывании исправляются механизмами коррекции ошибок внутри ядра, но некоторые мутации могут остаться незамеченными. Размер повторяющейся единицы, количество повторов и наличие вариантных повторов являются факторами, а также частота транскрипции в области повтора ДНК. Прерывание микросателлитов, возможно, из-за мутации, может привести к снижению полиморфизма. Однако этот же механизм иногда может приводить к неправильной амплификации микросателлитов; если смещение происходит на ранней стадии ПЦР, могут быть амплифицированы микросателлиты неправильной длины. Источник статьи, опубликованной в описании, — Википедия. Я делюсь их материалом. Авторские права принадлежат разработчикам оригинального контента. Ссылка: http://en.wikipedia.org/wiki/Main_Page