Духовное училище в Ишиме было основано в 1871–1872 годах и первоначально располагалось в разных зданиях. Новое каменное здание было заложено 10 мая 1884 года и освящено 21 ноября 1886 года. Училище было закрыто в 1919 году, а его здание использовалось для других целей.