Являются ли африканцы ближайшими современными родственниками неандертальцев? Расчеты FST для неан...
FST, или «индекс фиксации», — это показатель генетической дифференциации между популяциями. Он варьируется от 0 до 1, где 0 представляет две идентичные популяции, а 1 — две совершенно неродственные популяции. FST широко используется в популяционной генетике для построения филогений, классификации популяций по кластерам, а также для выявления генетического дрейфа и генного потока. ADMIXTOOLS — это программный пакет, разработанный лабораторией Дэвида Райха в Гарварде, широко используемый для изучения популяционной генетики и смешения популяций. Гарвардская лаборатория создала множество общедоступных наборов данных, которые можно анализировать с помощью admixtools. Для этого видео я использовал их набор данных 1240K плюс HO, где 1240K представляет количество проанализированных SNP, а HO означает «происхождение человека». Это два разных набора данных, но я использовал версию, которая объединяет их. Я рассчитал FST между гориллами, орангутанами, шимпанзе, неандертальцами и денисовцами, а также некоторыми популяциями современных людей. Вот результаты. Приобрести мой TraitPredictor можно здесь: https://andreikh.itch.io/trait-predictor Приобрести мои услуги по анализу ДНК (анализ QPADM, запуск FST, координаты AD16) можно здесь: https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSch2zgjdw20j-1ql7CrgATCOfY1gvyGXTqHgaa4v1DCx55FlA/viewform?usp=header
Название:
Являются ли африканцы ближайшими современными родственниками неандертальцев? Расчеты FST для неан...
Категория:
Разное