Взаимодействие генов проявляется в различных формах: полное и неполное доминирование, кодоминирование, эпистаз, комплементарность, полимерия и кооперация. При полном доминировании доминантный аллель подавляет рецессивный (расщепление 3:1), а при неполном — оба аллеля частично проявляются (1:2:1). Кодоминирование (например, 4 группа крови) — оба аллеля действуют одновременно. Эпистаз — подавление одного гена другим (13:3 или 9:3:4). Комплементарность требует взаимодействия двух доминантных генов для проявления признака. Полимерия усиливает признак при накоплении доминантных генов (цвет кожи). Кооперация формирует новый признак при взаимодействии двух генов (15:1).