RFOptimization: Improving Protein Designs Through Sequence Optimization

Как улучшить существующие конструкции белков, не начиная с нуля? В этом вебинаре по Rosetta Commons Toolkit Тускан Томпсон из Института дизайна белков Вашингтонского университета представит RFOptimization — вычислительный инструмент для уточнения конструкций белков посредством целевой оптимизации последовательности. RFO исследует локальное пространство последовательностей для повышения прогнозируемой достоверности связывания и уточнения перспективных конструкций, которые могут не соответствовать традиционным пороговым значениям фильтрации. Этот подход сочетает оптимизацию с градиентным управлением с итеративным проектированием последовательности и предсказанием структуры. На этом вебинаре вы узнаете: Как работает RFO и принципы его подхода к оптимизации Как RFO может применяться к связывающим белкам, антителам, циклическим пептидам, ферментам и другим биомолекулярным конструкциям Результаты и примеры, демонстрирующие улучшение прогнозируемого качества конструкции Как установить, настроить и запустить RFO Практические рекомендации по настройкам оптимизации, рабочим процессам и устранению неполадок Презентация включает обзор метода, практические демонстрации и сессию вопросов и ответов в прямом эфире. Докладчик: Тускан Томпсон, лаборатории Бейкера/ДиМайо, Вашингтонский университет, Сиэтл Ссылки по теме: Препринт: https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.04.749184v2 Github: https://github.com/RosettaCommons/foundry/tree/production/models/rfo