Строительство станции Ишим началось одновременно со строительством железной дороги, соединяющей крупные города западной Сибири: Тюмень и Омск. Тюменский городской глава А. И. Текутьев отмечал, что "линия от Тюмени до Омска – путь государственного значения, постройка которого не может быть отлагаема даже и при затруднительных обстоятельствах".